Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atl3Q91YH5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms