Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms