Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms