Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q8VDP2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q8VDP2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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