Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc8Q8VD72 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms