Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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