Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Impg1Q8R1W8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Impg1Q8R1W8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Impg1Q8R1W8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Impg1Q8R1W8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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