Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OptnQ8K3K8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms