Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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