Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pkn3Q8K045 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pkn3Q8K045 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pkn3Q8K045 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn3Q8K045 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pkn3Q8K045 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms