Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms