Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef8Q8CE24 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms