Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc63Q8CDV6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms