Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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