Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufl1Q8CCJ3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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