Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms