Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Atg4aQ8C9S8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atg4aQ8C9S8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atg4aQ8C9S8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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