Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms