Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd9Q8BYH8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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