Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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