Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjd4Q8BSD4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms