Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms