Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms