Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim19Q80ZU4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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