Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pcsk9Q80W65 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcsk9Q80W65 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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