Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms