Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc155Q80VJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc155Q80VJ8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms