Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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