Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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