Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms