Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrc2bQ7TPM1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms