Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms