Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspg5Q71M36 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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