Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cnih3Q6ZWS4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms