Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Topbp1Q6ZQF0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms