Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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