Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbtb40Q6PCS8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbtb40Q6PCS8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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