Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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