Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms