Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms