Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms