Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms