Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms