Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkciQ62074 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkciQ62074 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms