Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ifna11Q61716 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms