Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrxQ61687 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrxQ61687 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms