Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms