Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
JrkQ60976 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms