Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms