Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms